南京公司注册商标是一个系统而复杂的过程，涉及多个环节和步骤。以下是该流程的全景概览，帮助公司更好地理解和规划南京商标注册工作。

一、前期准备阶段

商标设计：公司根据品牌定位和市场策略设计独特的商标。

商标查询：通过官方渠道或专业机构查询商标是否已被注册或使用，避免侵权风险。

二、申请提交阶段

准备材料：整理并准备齐全商标注册所需的各项材料，包括申请书、商标图样、营业执照等。

提交申请：通过线上或线下渠道向南京市市场监督管理局（或指定机构）提交商标注册申请，并缴纳相应费用。

三、审查阶段

形式审查：商标局对申请材料进行初步审核，确保文件完整、格式正确。

实质审查：深入评估商标的显著性、合法性及与现有商标的区别性，确保商标的可注册性。

四、公告与异议阶段

公告：通过审查的商标将在商标局官网进行公告，接受社会监督。

异议处理：针对公告的商标，任何人可提出异议。商标局将审查异议并作出裁决。

五、注册完成阶段

领取证书：若商标公告期满无异议或异议不成立，公司将获得《商标注册证》，标志着商标注册成功。

后续维护：获得注册证后，公司需定期进行商标续展、变更等维护工作，确保商标权益的持续有效。

整个流程中，公司需密切关注各个环节的进展情况，及时响应商标局的要求和通知，以确保商标注册工作的顺利进行。同时，建议公司寻求专业律师或代理机构的帮助，以提高商标注册的成功率和效率。